Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms