Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC102BQ68D86 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC102BQ68D86 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC102BQ68D86 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms