Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZKSCAN2Q63HK3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZKSCAN2Q63HK3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms