Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf57Q5W0N0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms