Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms