Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF6Q5VXH4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF6Q5VXH4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms