Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38BQ5VTL8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms