Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFAP70Q5T0N1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CFAP70Q5T0N1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CFAP70Q5T0N1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CFAP70Q5T0N1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CFAP70Q5T0N1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CFAP70Q5T0N1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CFAP70Q5T0N1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
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