Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD4BQ5PRF9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms