Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms