Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms