Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF394Q53GI3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms