Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms