Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms