Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms