Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms