Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA3Q16787 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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