Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNXAQ16473 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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