Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTRK3Q16288 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
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