Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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