Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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