Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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