Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
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