Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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