Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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