Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPHQ15003 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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