Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALCAMQ13740 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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