Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms