Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL3Q13618 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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