Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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