Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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TMED1Q13445 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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TMED1Q13445 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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TMED1Q13445 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
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