Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE3BQ13370 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE3BQ13370 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
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