Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CBX3Q13185 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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