Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ACACAQ13085 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACACAQ13085 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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