Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKRN3Q13064 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN3Q13064 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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