Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRDNQ13061 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRDNQ13061 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
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