Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIK2Q13002 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIK2Q13002 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK2Q13002 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK2Q13002 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms