Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSTF3Q12996 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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