Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN13Q12923 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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