Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRJQ12913 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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