Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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RAB40BQ12829 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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RAB40BQ12829 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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