Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFEMP1Q12805 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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