Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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GTF3C1Q12789 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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GTF3C1Q12789 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C1Q12789 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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