Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAPQ12770 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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