Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
NUP160Q12769 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NUP160Q12769 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms