Protein–RNA interactions for Protein: Q12042

YPL162C, Vacuolar membrane protein YPL162C, yeastyeast

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL162CQ12042 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.4□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 snR42snR42 351 nt2.4□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 DUN1YDL101C 1542 nt2.4□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 EXO84YBR102C 2262 nt2.4□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 MTL1YGR023W 1656 nt2.4□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 KIN82YCR091W 2163 nt2.4□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 STE23YLR389C 3084 nt2.4□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YPS6YIR039C 1614 nt2.39□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 SAP1YER047C 2694 nt2.39□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 ARF1YDL192W 546 nt2.39□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 HTA1YDR225W 399 nt2.39□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 FMP32YFL046W 624 nt2.39□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 EFG1YGR271C-A 702 nt2.39□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 SDS3YIL084C 984 nt2.39□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 SDH3YKL141W 597 nt2.39□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 HRT1YOL133W 366 nt2.39□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YOR062CYOR062C 807 nt2.39□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 PUF6YDR496C 1971 nt2.39□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 RGC1YPR115W 3252 nt2.39□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 KRE2YDR483W 1329 nt2.39□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 DIA2YOR080W 2199 nt2.39□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 ECM18YDR125C 1362 nt2.38□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 ECM29YHL030W 5607 nt2.38□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 RRP42YDL111C 798 nt2.38□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 TAN1YGL232W 870 nt2.38□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 MNT3YIL014W 1893 nt2.38□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 AGE2YIL044C 897 nt2.38□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 GLG2YJL137C 1143 nt2.38□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 RDN58-1RDN58-1 158 nt2.38□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 RDN58-2RDN58-2 158 nt2.38□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YNR062CYNR062C 984 nt2.38□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 SYC1YOR179C 567 nt2.38□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 PIN3YPR154W 648 nt2.38□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 NOP4YPL043W 2058 nt2.38□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 MET5YJR137C 4329 nt2.38□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 PDC2YDR081C 2778 nt2.38□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 HFM1YGL251C 3564 nt2.38□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YCG1YDR325W 3108 nt2.37□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 PTI1YGR156W 1278 nt2.37□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YGR190CYGR190C 366 nt2.37□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YHL005CYHL005C 393 nt2.37□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 RPL6AYML073C 531 nt2.37□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YBL028CYBL028C 321 nt2.37□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 SPC24YMR117C 642 nt2.37□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YBL096CYBL096C 309 nt2.37□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 SEC7YDR170C 6030 nt2.37□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 TPO5YKL174C 1857 nt2.37□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 RIM1YCR028C-A 408 nt2.36□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YHR097CYHR097C 1101 nt2.36□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YLR290CYLR290C 834 nt2.36□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YLR297WYLR297W 390 nt2.36□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 GLO1YML004C 981 nt2.36□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 MDM1YML104C 3384 nt2.36□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 GYL1YMR192W 2163 nt2.35□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 MED2YDL005C 1296 nt2.35□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YDL050CYDL050C 372 nt2.35□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YDR222WYDR222W 1248 nt2.35□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YEL075CYEL075C 369 nt2.35□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YGR064WYGR064W 369 nt2.35□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt2.35□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 RCE1YMR274C 948 nt2.35□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 AAR2YBL074C 1068 nt2.35□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 MRPL27YBR282W 441 nt2.35□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 RIX1YHR197W 2292 nt2.35□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 NSA1YGL111W 1392 nt2.35□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 NUF2YOL069W 1356 nt2.35□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 PKP2YGL059W 1476 nt2.34□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YCR015CYCR015C 954 nt2.34□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt2.34□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 RPL27AYHR010W 411 nt2.34□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YIL024CYIL024C 570 nt2.34□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 DCG1YIR030C 735 nt2.34□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 PIR1YKL164C 1026 nt2.34□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YLR076CYLR076C 423 nt2.34□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 YNL035CYNL035C 1170 nt2.34□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 RPS10AYOR293W 318 nt2.34□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 LCL1YPL056C 306 nt2.34□□□□□ -2.03
YPL162CQ12042 CET1YPL228W 1650 nt2.34□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 TAF2YCR042C 4224 nt2.34□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 EPL1YFL024C 2499 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 RED1YLR263W 2484 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 SWR1YDR334W 4545 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 NHP10YDL002C 612 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 RAD55YDR076W 1221 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 YDR090CYDR090C 933 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 RRT13YER066W 558 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 YGR073CYGR073C 372 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 PPX1YHR201C 1194 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 YJL175WYJL175W 513 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 NDL1YLR254C 570 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 TEM1YML064C 738 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 TRM112YNR046W 408 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 RPA43YOR340C 981 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 YPR203WYPR203W 309 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 YBR116CYBR116C 528 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 YGR067CYGR067C 2415 nt2.33□□□□□ -2.04
YPL162CQ12042 MED1YPR070W 1701 nt2.33□□□□□ -2.04
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