Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CPSF1Q10570 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CPSF1Q10570 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPSF1Q10570 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
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