Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms