Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX8Q06710 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms