Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNEQ04844 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNEQ04844 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms